Scholar Hub/Chủ đề/#động lực học phân tử/
Động lực học phân tử là một lĩnh vực trong hóa học nghiên cứu về các quá trình tạo thành và phá vỡ liên kết giữa các nguyên tử trong phân tử. Nó liên quan đến v...
Động lực học phân tử là một lĩnh vực trong hóa học nghiên cứu về các quá trình tạo thành và phá vỡ liên kết giữa các nguyên tử trong phân tử. Nó liên quan đến việc xem xét các lực và năng lượng liên quan đến các quá trình diễn ra trong hệ thống phân tử.
Động lực học phân tử cung cấp thông tin về cấu trúc và tính chất của phân tử, bao gồm các thông số như khoảng cách giữa các nguyên tử, góc liên kết, năng lượng và độ bền của các liên kết. Nó có thể được áp dụng để dự đoán và giải thích các hiện tượng hóa học như phản ứng hóa học, tác động của điều kiện môi trường đến cấu trúc và tính chất của các phân tử, và các hiện tượng liên quan đến động học và năng lượng.
Động lực học phân tử sử dụng các phương pháp và công cụ tính toán để mô phỏng và dự đoán các quá trình diễn ra trong hệ thống phân tử. Nó đóng vai trò quan trọng trong việc phân tích và hiểu các hiệu ứng liên quan đến cấu trúc và tính chất của phân tử, từ đó đóng góp vào phát triển và ứng dụng trong lĩnh vực hóa học và các lĩnh vực liên quan khác.
Động lực học phân tử tập trung vào việc nghiên cứu các lực và năng lượng tác động lên các nguyên tử và liên kết giữa chúng trong một phân tử. Các lực và năng lượng này sẽ ảnh hưởng đến cấu trúc và tính chất của phân tử, bao gồm độ dài và góc của liên kết, độ bền của phân tử, năng lượng cần để phá vỡ các liên kết và các quá trình tạo thành và phá vỡ liên kết.
Động lực học phân tử sử dụng nền tảng của lý thuyết cấu trúc điện tử và cơ thể lý thuyết lượng tử để xây dựng mô hình và dự đoán cấu trúc phân tử. Các phương trình và phương pháp tính toán được sử dụng để tính toán các tham số như năng lượng, độ giảm hạt, hàm sóng, hàm lượng tử, và mật độ tham số để mô phỏng và dự đoán các hiện tượng phân tử.
Các công cụ và phương pháp tính toán trong động lực học phân tử bao gồm phân tử học cổ điển, phương pháp tiếp cận một điện tử, phân tử cấu trúc mạng, và các phương pháp tính toán lượng tử chính xác hơn như phương pháp Hartree-Fock, phương pháp bản địa, và phương pháp hàm mật độ.
Áp dụng của động lực học phân tử rất rộng, từ việc dự đoán và định lượng các hiệu ứng phụ của các hợp chất hóa học đến phân tích và đánh giá tính chất vật lý và hoá học của hợp chất. Nó được sử dụng trong nhiều lĩnh vực như thiết kế thuốc, nghiên cứu vật liệu, chiến lược nghiên cứu phản ứng hóa học, và các ứng dụng trong công nghệ và y sinh học.
Động lực học phân tử với sự ghép nối tới bể nhiệt độ bên ngoài Dịch bởi AI Journal of Chemical Physics - Tập 81 Số 8 - Trang 3684-3690 - 1984
Trong các mô phỏng động lực học phân tử (MD), cần thiết thường xuyên để duy trì các tham số như nhiệt độ hoặc áp suất thay vì năng lượng và thể tích, hoặc để đặt các gradient nhằm nghiên cứu các tính chất vận chuyển trong MD không cân bằng. Một phương pháp được mô tả để thực hiện việc ghép nối với một bể bên ngoài có nhiệt độ hoặc áp suất không đổi với các hằng số thời gian ghép nối có thể...... hiện toàn bộ Chuyển biến đa hình trong tinh thể đơn: Một phương pháp động lực học phân tử mới Dịch bởi AI Journal of Applied Physics - Tập 52 Số 12 - Trang 7182-7190 - 1981
Một dạng thức Lagrangian mới được giới thiệu. Nó có thể được sử dụng để thực hiện các phép tính động lực học phân tử (MD) trên các hệ thống dưới các điều kiện ứng suất bên ngoài tổng quát nhất. Trong dạng thức này, hình dạng và kích thước của ô MD có thể thay đổi theo các phương trình động lực học do Lagrangian này cung cấp. Kỹ thuật MD mới này rất phù hợp để nghiên cứu những biến đổi cấu...... hiện toàn bộ #Động lực học phân tử #ứng suất #biến dạng #chuyển biến đa hình #tinh thể đơn #mô hình Ni
Động lực học phân tử mở rộng với NAMD Dịch bởi AI Journal of Computational Chemistry - Tập 26 Số 16 - Trang 1781-1802 - 2005
Tóm tắtNAMD là một mã động lực học phân tử song song được thiết kế cho mô phỏng hiệu suất cao của các hệ thống sinh phân tử lớn. NAMD có khả năng mở rộng đến hàng trăm bộ xử lý trên các nền tảng song song hiệu năng cao, cũng như hàng chục bộ xử lý trên các cụm giá rẻ, và cũng có thể chạy trên máy tính để bàn và máy tính xách tay cá nhân. NAMD hoạt động với các hàm ...... hiện toàn bộ Một công thức thống nhất cho các phương pháp động lực học phân tử ở nhiệt độ không đổi Dịch bởi AI Journal of Chemical Physics - Tập 81 Số 1 - Trang 511-519 - 1984
Bài báo phân tích ba phương pháp động lực học phân tử ở nhiệt độ không đổi được đề xuất gần đây bao gồm: (i) Nosé (Mol. Phys., sẽ được công bố); (ii) Hoover và cộng sự [Phys. Rev. Lett. 48, 1818 (1982)], và Evans cùng Morriss [Chem. Phys. 77, 63 (1983)]; và (iii) Haile và Gupta [J. Chem. Phys. 79, 3067 (1983)]. Chúng tôi đã phân tích các phương pháp này một cách lý thuyết bằng cách tính to...... hiện toàn bộ CHARMM: Một chương trình cho tính toán năng lượng vĩ mô, tối ưu hóa và động lực học Dịch bởi AI Journal of Computational Chemistry - Tập 4 Số 2 - Trang 187-217 - 1983
Tóm tắtCHARMM (Hóa học tại Harvard Macromolecular Mechanics) là một chương trình máy tính linh hoạt cao sử dụng các hàm năng lượng thực nghiệm để mô phỏng các hệ thống vĩ mô. Chương trình có thể đọc hoặc tạo mô hình cấu trúc, tối ưu hóa năng lượng cho chúng bằng kỹ thuật đạo hàm bậc nhất hoặc bậc hai, thực hiện mô phỏng chế độ bình thường hoặc động lực học phân tử,...... hiện toàn bộ #CHARMM #hóa học vĩ mô #tối ưu hóa năng lượng #động lực học phân tử #mô phỏng hệ thống vĩ mô
Phương pháp phần tử hữu hạn cho rung động áp điện Dịch bởi AI International Journal for Numerical Methods in Engineering - Tập 2 Số 2 - Trang 151-157 - 1970
Tóm tắtMột công thức phần tử hữu hạn bao gồm hiệu ứng áp điện hoặc điện cơ được trình bày. Một sự tương đồng mạnh mẽ được thể hiện giữa các biến điện và biến đàn hồi, và một phương pháp phần tử hữu hạn ‘độ cứng’ đã được suy ra. Phương trình ma trận động của điện cơ được xây dựng và được phát hiện có thể chuyển dạng thành phương trình động lực học cấu trúc đã biết. ...... hiện toàn bộ #áp điện #điện cơ #phần tử hữu hạn #độ cứng #động lực học #không gian ba chiều #hình tứ diện
Cơ học và Động lực học Phân tử của Sự thu hút Bạch cầu trong Quá trình Viêm Dịch bởi AI Annual Review of Biomedical Engineering - Tập 7 Số 1 - Trang 151-185 - 2005
▪ Tóm tắt Sự phát hiện các gen và protein mới trực tiếp hỗ trợ cho sự bám dính của bạch cầu đang giảm dần, trong khi đó mối quan tâm đến cơ học tế bào và động lực học thụ thể dẫn đến từ sự gắn kết tạm thời qua các selectin đến sự thay đổi ái lực và tăng cường sự bám dính thông qua các integrin đang tăng cao. Các công cụ quang học mới cho phép hình ảnh hóa thời gian thực quá trình lăn và d...... hiện toàn bộ Giảm thiểu dimethylsulfoxide bằng hydro phân tử sử dụng phức chất rhodium(III) Dịch bởi AI Canadian Science Publishing - Tập 47 Số 24 - Trang 4521-4526 - 1969
Dimethylsulfoxide được khử bởi hydro phân tử trong điều kiện nhẹ để tạo thành dimethylsulfide và nước trong sự hiện diện của các phức chất rhodium(III) như chất xúc tác. Động lực học của các hệ thống sử dụng RhCl3.3H2O và cis-RhCl3(Et2S)3 đã được nghiên cứu, và cơ chế liên quan đến quá...... hiện toàn bộ #dimethylsulfoxide; hydro phân tử; rhodium(III); động lực học; xúc tác
